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新冠肺炎爆發至今已兩月有余，學者們對病毒源頭的追溯也從未停歇。
2 月 20 日，中國科學院西雙版納熱帶植物園通過官網發布研究成果信息稱，武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入的 ，推論此市場不是病毒發源地。而人際傳播在可能 2019 年 12 月，甚至 11月下旬便開始了。
研究人員收集了截止 2 月 12 日全世界共享到 GISAID EpiFluTM 數據庫的病毒數據，包括四大洲 12 個國家的 93 個新冠病毒樣本。其中，來自湖北武漢的樣本的取樣截止日期為 1 月 5 日，全球樣本的最晚取樣日期是 2 月 3 日。
結論一：華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入的
通過全基因組數據解析，研究者發現收集到的 93 個樣本包含 58 種單倍型（基因類型 haplotypes，即若干個決定同一性狀的緊密連鎖的基因構成的基因型），以超級傳播者單倍型為中心，研究者將其歸納為 5組，它們共同構成一個病毒進化網絡。5 個中心分別為 3 個古老超級傳播者單倍型 H1 、H3 和 H13 ，以及 2 個新的超級傳播者單倍型 H56 、mv2 。其中，H1 單倍型最多，其衍生單倍型也最多。單倍型演化網絡顯示，所有單倍型中，單倍型 H13 和 H38 可能是古老/祖先單倍型，它們可能通過一個中間單倍型與蝙蝠冠狀病毒 RaTG13 相關聯，由于目前的樣品中沒有第一例感染者的樣本和 12 月初的早期感染者的樣本，最初的古老/祖先單倍型可能還沒有被發現。
而與華南海鮮市場有關聯的患者樣品的單倍型都是 H1 及其衍生的單倍型 H2 及 H8-H12 ，這表明市場在短期內存在傳播感染。此外，有一份武漢樣品單倍型 H3 與華南海鮮市場無關，研究人員認為，H1 及其衍生的單倍型可能起源于 H3 ，華南海鮮市場不存在新冠病毒原始來源，新冠病毒可能是從其它地方輸入。此前的研究也顯示，首先確定的受感染患者與市場沒有聯系，因而研究者認為可能是感染者將病毒傳播給市場上的工人或賣方，然后迅速在市場上流通，擁擠的市場促進了病毒進一步傳播給買家，并于 2019 年 12 月上旬傳播開來。
這個研究也印證了此前 1 月 24 日發表在《柳葉刀》的研究結論，即追蹤第一批 41 個確診病例發現，這批最早在 12 月 1 日報告的病例中，總共有 13 個病例與海鮮市場無接觸史。也就是說，病毒在進入海鮮市場之前就已經潛入武漢居民的生活中，但華南海鮮市場依舊是病毒擴散的“中介”之一。
結論二：新型冠狀病毒或在 12 月初和 1 月 6 日左右發生過 2 次明顯的種群擴張
此外，根據新型冠狀病毒基因組數據推算 1 月之前的種群擴張發生時間是 12 月 8 日，該結果暗示病毒可能在 12 月初，甚至 11 月下旬即已經開始有人際傳播，隨后在華南海鮮市場加快了人際傳播。研究推算 2 月份之前的種群擴張時間在 1 月 6 日，這個可能與元旦假期有關聯。需要指出，這一天國家疾控中心發布了 2級應急響應。當時的預警起到了一些警示作用，公眾活動和出行都有所減少。
如果當時的警示能引起大眾更廣泛的重視，那么1月份中下旬向全國和全球蔓延的病例會有所降低。研究人員進一步確認我國其他 9個省區和其他 11 個國家的感染病例基本都是從武漢直接或者間接輸入而來。
結論三：現擴散的病例至少來自于 3 個途徑
另外，為了能夠細分來源，研究人員將 58 種單倍型分成了五組，采用標準是 3 個中心（古老超級傳播者）單倍型（H1, H3 和 H13 ）和 2個 新的超級傳播者單倍型（ H56 和 mv 2）。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源，重慶和臺灣的病毒有兩個來源。
其中，廣東深圳一家人在早期就通過人傳人進行了傳播。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國，他們的患者感染源至少有兩個，尤其是美國包括了五個來源。
非常值得關注的是 H56 這個超級傳播者單倍型，它同時是澳大利亞、法國和美國，以及我國臺灣患者的傳染源。其他國家患者因為樣品比較少，大多數的來源比較單一，他們除了是武漢旅游輸入或在武漢感染外，有一些人可能是在廣東、新加坡等地被感染。
結論四，新冠病毒基因組尚未發生重組事件
好消息是，研究人員發現新冠病毒基因組沒有發生明顯的重組事件。他們在 8 個蛋白質編碼區發現了120 個核苷酸突變點位，基因組中的 10 個蛋白質編碼區的突變點位均勻分布。
120 個突變的核苷酸關聯了 119 個氨基酸密碼子，其中 79 個密碼子 （ 65.83% ）改變了氨基酸類型，并有 42 個（ 53.17% ）氨基酸理化性質都被改變。目前研究者尚不清楚這些氨基酸類型以及理化性質改變是否會影響新冠病毒的活性，需要其他蛋白組學和結構生物學方面的專業人士進行驗證。
誠然，確定海鮮市場是不是病毒發源地對于尋找病毒的來源，以及確定中間宿主，對疫情的控制和避免再次爆發具有至關重要的意義，但吃瓜群眾們對病毒源頭究竟是誰更為撲朔迷離。
日本朝日電視臺昨日傍晚報道，宣稱“ CDC 美國疾病管理預防中心發布驚人的消息，懷疑一萬多的流感死亡人數中，有一部分是死于新冠肺炎的，檢查體制有漏洞，已經開始新的檢測方式，并呼吁有新冠癥狀的患者重新檢查……”
網友們便開始猜測：難道幕后的黑手是美軍？
但問題是，即便幕后黑手是美國，美國為什么要這么做呢？
按照網友們的猜測，美國來中國參加軍運會時，美國正在爆發流感，最后一批最晚 11 月 15 日離開， 12 月底武漢就發現了受感染的新冠病毒患者，時間不可謂不巧合......但這似乎也不是我們應該懷疑美國的理由，畢竟，在真相出來之前，誰都不能妄下定論。
帶著好奇心，雷鋒網編輯也查詢了 CDC 官方網站，我們發現在其最新更新的報告中有很多有關“很多病人患的 并不是流感”的內容，但部分人的流感病毒類型尚未確定，而 CDC 也并未指出，該類型尚未確定的流感病毒就是新型冠狀病毒，也沒有指出美國因流感死亡的人中，有人是死于患有新冠肺炎。當然，美國 CDC 也沒有說過“美國流感可能掩蓋了新冠病毒在美國的傳播”。
此外，CDC 也在原文報道中稱，現在是流感季，令發現/確診新冠肺炎變得更加困難，因此 CDC 將與五個實驗室合作，利用其現有流感監測網絡來測試具有類流感癥狀的人是否有新冠肺炎，而上述措施只是為了預防流感更大范圍的流行。
顯然，日媒報道的這一新聞有“夸大其詞”之嫌。
所以，雷鋒網在這里建議大家：不要陰謀論，不要陰謀論，不要陰謀論！不要偏聽偏信，要實事求是。當下，最為緊要的還是要先找到零號病人。雷鋒網雷鋒網
參考資料：
Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data
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