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| 本文作者： 喬燕薇 | 2022-09-21 15:19 |
雷峰網(wǎng)(公眾號：雷峰網(wǎng))消息，2022年9月21日，百奧幾何宣布完成千萬美元天使輪融資，投資方為高榕資本。團隊也發(fā)布了首個針對大分子藥物研發(fā)的開源機器學習平臺TorchProtein，致力于通過AI加速藥物研發(fā)的進程。
百奧幾何由加拿大蒙特利爾大學算法研究所（Mila）的副教授、終身教授唐建博士于2021年創(chuàng)立，致力于開發(fā)幾何深度學習、深度生成模型等下一代人工智能技術，用于大分子藥物研發(fā)。公司也獲得了圖靈獎獲得者、深度學習三巨頭之一、加拿大蒙特利爾大學教授Yoshua Bengio的認可和支持，將擔任公司的科學顧問。公司正打造人工智能大分子藥物設計和高通量大分子藥物濕實驗驗證兩大基礎平臺，通過干濕實驗閉環(huán)，快速完成候選藥物設計以及提高候選藥物在臨床階段的成功率。
計算能力的持續(xù)提高，加上高通量生物數(shù)據(jù)生產(chǎn)的指數(shù)級增長，為科學家?guī)砹怂幬锇l(fā)現(xiàn)和開發(fā)的新時代。從分子、蛋白質到醫(yī)療知識圖譜，透過海量的圖結構數(shù)據(jù)，AI模型和數(shù)據(jù)集在不斷改寫著生物制藥的格局。
百奧幾何創(chuàng)始人唐建博士畢業(yè)于北京大學信息科學學院，曾在微軟亞洲研究院擔任研究員，并在美國卡耐基梅隆以及密歇根大學進行博士后研究。唐建博士在圖表示學習領域做了諸多開創(chuàng)性的工作，也是國際上最早把深度學習運用于圖結構數(shù)據(jù)的少數(shù)幾名學者之一。
唐建博士曾獲得機器學習領域三大頂級會議ICML’14的最佳論文（國內唯一）以及數(shù)據(jù)挖掘領域頂級會議WWW‘16的最佳論文提名。他在圖表示學習領域的代表性工作LINE 2015年發(fā)表以來已經(jīng)被國內外高校、工業(yè)界廣泛認可，引用超過4500次。他多次擔任機器學習頂級會議ICML、NeurIPS的領域主席，并且多次獲得包括亞馬遜、騰訊等公司的教師科研獎。
早在2018年，唐建博士在圖表示學習研究中意識到，最殺手級的應用或將誕生在生物醫(yī)藥領域。唐建博士開創(chuàng)性地把圖表示學習和幾何深度學習技術運用到藥物研發(fā)領域，在分子性質預測、結構性質預測上，進行了大量創(chuàng)新性的研究工作。唐建博士領銜團隊開發(fā)了第一個專門針對藥物研發(fā)的開源機器學習系統(tǒng)TorchDrug，旨在推進人工智能在藥物發(fā)現(xiàn)方向的開源共享，加速整個藥物研發(fā)的進展，引起了廣泛關注。
目前，百奧幾何已基本完成人工智能大分子藥物設計平臺建設，在抗體結構預測、抗體優(yōu)化、抗體序列設計、酶活性預測等任務上都取得了國際領先的水平。
公司的高通量大分子藥物濕實驗驗證平臺，也正聯(lián)合生物醫(yī)藥領域知名高校和實驗室展開建設，推進前沿工作。公司希望通過干濕實驗閉環(huán)，加速藥物研發(fā)進程。
與此同時，團隊也聯(lián)合英偉達、英特爾、IBM等公司聯(lián)合發(fā)布了首個針對大分子藥物研發(fā)的開源機器學習平臺TorchProtein。該平臺開源了深度學習對大分子建模的一個通用框架、基于蛋白質三維幾何結構的第一個預訓練大模型、以及專門用于評價深度學習對蛋白質建模效果的標準數(shù)據(jù)集。
團隊目前已經(jīng)與國內外多家著名高校、企業(yè)都建立了合作關系，共同推進人工智能在藥物研發(fā)方向的進展。
唐建博士表示，“當前我們正處在AI以及生物技術革命的交匯點。一方面，幾何深度學習技術（如AlphaFold2）在分子建模方面取得了巨大突破；另一方面，以合成生物學為代表的生物技術能夠對基因進行快速讀、寫、以及編輯，給AI創(chuàng)造了大量的數(shù)據(jù)。兩種革命技術的深度融合為生物大分子設計帶來了巨大的機會。”
高榕資本創(chuàng)始合伙人岳斌表示，“計算領域的突破，正在重構藥物發(fā)現(xiàn)的過程。我們相信，人工智能可以幫助大分子藥物研發(fā)取得很大的進展。唐建博士將圖表示學習和幾何深度學習技術運用到藥物研發(fā)領域，做了非常多開創(chuàng)性的工作，也在抗體優(yōu)化、抗體結構預測任務上取得了國際領先的技術。期待百奧幾何通過下一代人工智能技術，加速藥物研發(fā)進程，解決重大疾病挑戰(zhàn)。”
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